工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名的高中生(shēng )侦探，在一次(cì )追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠(lì )博士，博(bó )士为他(tā )度身打造不(bú )少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查(chá )他们，希(xī )望能得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠(lì )博(bó )士的家寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新(xīn )一情急(jí )之下(xià )编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识(shí )步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！