工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成(chéng )员发(fā )现，击(jī )晕后喂了(le )神奇的药水，工(gōng )藤新(xīn )一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间(jiān )谍(dié )武器(qì )。为了(le )防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之(zhī )下(xià )编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办(bàn )案(àn )一(yī )起追查黑夜人的(de )下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！