工藤新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中(zhōng )生(shēng )侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神(shén )奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复(fù )，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利兰(lán )来(lái )到了阿笠博士(shì )的家(jiā )寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编(biān )造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探(tàn )，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南(nán )在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！