工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回(huí )了小孩(hái )！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到(dào )解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士的家寻找男(nán )友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随(suí )后柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一(yī )可以籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣战！