工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿(ā )笠(lì )博士的家寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见(jiàn )的(de )新(xīn )一情急之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是(shì )一(yī )名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个(gè )少(shǎo )年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战！