工藤(téng )新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助(zhù )他的阿笠博士(shì )，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠(lì )博士的(de )家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一名私(sī )家(jiā )侦探，新一可以籍着和(hé )他一起四(sì )出(chū )办案一起追查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！