工藤新一是(shì )全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪(zuì )团伙时不幸被(bèi )团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工(gōng )藤新一变(biàn )回(huí )了(le )小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身(shēn )打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博(bó )士的(de )家(jiā )寻找男友的下(xià )落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五(wǔ )郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了(le )一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！