工藤新一是全国(guó )著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了(le )经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们(men )，希望能得到(dào )解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博(bó )士(shì )的家寻找(zhǎo )男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着(zhe )和他一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！