工藤新一是全(quán )国(guó )著名的高(gāo )中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员(yuán )发现，击晕后喂了(le )神(shén )奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不(bú )少间谍武(wǔ )器(qì )。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下(xià )编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家(jiā )。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追(zhuī )查黑(hēi )夜(yè )人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！