工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人(rén )犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇(qí )的(de )药水(shuǐ )，工藤新一变回(huí )了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下(xià )编造了自(zì )己名(míng )叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步(bù )美等(děng )小学生(shēng )，他们(men )一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！