工藤新一是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的(de )药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行(háng )报复，新(xīn )一决(jué )定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新(xīn )一情急之下编(biān )造了自己名叫江户(hù )川柯(kē )南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家(jiā )侦(zhēn )探，新(xīn )一可以籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜(yè )人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！