工藤新一是全国(guó )著名(míng )的(de )高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇的(de )药(yào )水，工藤(téng )新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得(dé )到(dào )解药。一日(rì )，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻(xún )找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编(biān )造了自己名叫(jiào )江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄居在(zài )了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南(nán )在小学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！