工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕(yūn )后喂了神奇的药(yào )水，工藤新(xīn )一变回了(le )小孩！新一找到了(le )经(jīng )常帮助(zhù )他的阿(ā )笠博士(shì )，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的女友(yǒu )毛利兰(lán )来到(dào )了阿笠博(bó )士的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川(chuān )柯南，随后柯(kē )南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和他(tā )一起(qǐ )四出办案一起追查(chá )黑(hēi )夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一(yī )个少年(nián )侦探(tàn )团，向(xiàng )罪犯宣(xuān )战(zhàn )！