工藤新一是(shì )全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发(fā )现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博(bó )士(shì )，博(bó )士为他度身打造不(bú )少(shǎo )间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他(tā )进行报复，新一决(jué )定隐(yǐn )姓埋(mái )名，暗中追查(chá )他(tā )们(men )，希望能得(dé )到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！