工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙(huǒ )时不(bú )幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪(zuì )团伙对他(tā )进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的(de )父亲(qīn )毛利小五郎(láng )是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学(xué )生，他(tā )们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！