工藤(téng )新一是全国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了(le )经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他(tā )度(dù )身(shēn )打造不少(shǎo )间谍武器(qì )。为了(le )防止犯罪团伙对(duì )他进行报(bào )复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望(wàng )能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利(lì )兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个(gè )少(shǎo )年(nián )侦探团(tuán )，向罪犯宣战！