工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行(háng )报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男友(yǒu )的(de )下落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯(kē )南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四出(chū )办案一起追查(chá )黑夜人的下(xià )落。柯南在(zài )小学认识(shí )步(bù )美等小学生，他们(men )一起组织(zhī )了一(yī )个少年(nián )侦(zhēn )探(tàn )团，向罪犯宣战！