工藤新一是全国著名的(de )高中生(shēng )侦探，在(zài )一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工(gōng )藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士(shì )的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家(jiā )侦探(tàn )，新(xīn )一可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案(àn )一起追(zhuī )查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南在小学认识(shí )步美等小学生(shēng )，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！