工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望(wàng )能(néng )得(dé )到(dào )解药。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯(kē )南(nán )寄居在了(le )小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识步(bù )美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！