工藤新一(yī )是全(quán )国(guó )著(zhe )名的高(gāo )中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被(bèi )团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩(hái )！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药(yào )。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利(lì )兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南(nán )，随后(hòu )柯(kē )南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出(chū )办案一起(qǐ )追查(chá )黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！