工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑衣(yī )人犯罪(zuì )团(tuán )伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之(zhī )下编造了(le )自己名(míng )叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步(bù )美等小学生(shēng )，他们一起组织(zhī )了一个少(shǎo )年(nián )侦探团，向罪犯(fàn )宣战！