工藤(téng )新一是全(quán )国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追(zhuī )查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不(bú )幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博(bó )士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪(zuì )团伙对他进(jìn )行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰(lán )撞见的新一情(qíng )急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯(kē )南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯(fàn )宣战！