工藤新一(yī )是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望(wàng )能得到解药(yào )。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰(lán )来到(dào )了阿笠(lì )博(bó )士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下(xià )编(biān )造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在(zài )了小兰家。小兰(lán )的(de )父(fù )亲(qīn )毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四(sì )出办(bàn )案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战！