工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮(bāng )助他的阿(ā )笠博士，博士为他(tā )度身打造(zào )不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能(néng )得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男友的(de )下落(luò )，被小兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人(rén )的下落。柯南在小(xiǎo )学(xué )认识步美(měi )等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！