工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他(tā )度身(shēn )打造不(bú )少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行报复(fù )，新一(yī )决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰家。小兰的(de )父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是(shì )一名私(sī )家侦探，新一(yī )可以籍(jí )着和他一(yī )起(qǐ )四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了(le )一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣战！