工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团(tuán )伙(huǒ )时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变(biàn )回了小孩(hái )！新一找到了(le )经常帮(bāng )助他的阿笠博士(shì )，博士为他度(dù )身打造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们(men )，希(xī )望能得到解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士(shì )的(de )家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户(hù )川(chuān )柯南，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在(zài )小(xiǎo )学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！