工(gōng )藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一 的(de )女友毛利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一(yī )起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学(xué )生，他们一(yī )起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣战！