工(gōng )藤新一是全(quán )国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙(huǒ )时(shí )不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发(fā )现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰(lán )来(lái )到了(le )阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情急之下(xià )编(biān )造了自己(jǐ )名叫江户(hù )川(chuān )柯南(nán )，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是一名私家侦(zhēn )探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！