工藤新一(yī )是全国著名的(de )高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追(zhuī )查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不(bú )少(shǎo )间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情(qíng )急之下(xià )编造(zào )了(le )自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是(shì )一名私家侦探，新一(yī )可以籍(jí )着和他一起四出办(bàn )案一(yī )起(qǐ )追查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！