工藤新一是全国著(zhe )名的(de )高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮助(zhù )他的阿笠博士(shì )，博(bó )士为他(tā )度身打(dǎ )造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的(de )女友(yǒu )毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的(de )下落，被小兰(lán )撞见的(de )新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一(yī )可以籍(jí )着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小学生，他们(men )一(yī )起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣(xuān )战！