工(gōng )藤新(xīn )一是全国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛(máo )利兰(lán )来到了(le )阿笠博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是(shì )一(yī )名(míng )私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南(nán )在(zài )小(xiǎo )学认识步美等(děng )小学生，他(tā )们(men )一起组织(zhī )了一个少年(nián )侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战(zhàn )！