工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了(le )经常帮助他(tā )的阿笠博士，博(bó )士为(wéi )他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男(nán )友的下(xià )落(luò )，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利(lì )小五(wǔ )郎是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一(yī )起(qǐ )追查(chá )黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！