工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次(cì )追查黑衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了(le )小孩(hái )！新(xīn )一找到了(le )经常帮(bāng )助(zhù )他的阿(ā )笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进行报复，新一(yī )决(jué )定隐(yǐn )姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女(nǚ )友(yǒu )毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被(bèi )小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新(xīn )一可以籍(jí )着和他一(yī )起四出办案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一(yī )个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！