工藤新一是(shì )全国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新(xīn )一变(biàn )回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博(bó )士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被(bèi )小兰撞见(jiàn )的新一情急(jí )之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起(qǐ )四出办案一(yī )起追查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学(xué )认识步美等小学(xué )生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！