工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造(zào )不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得(dé )到(dào )解药(yào )。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰(lán )来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻找(zhǎo )男(nán )友(yǒu )的(de )下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四(sì )出办案一起追查黑夜人(rén )的(de )下(xià )落。柯南在(zài )小学认(rèn )识步美等小学生，他们一(yī )起(qǐ )组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！