工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工(gōng )藤(téng )新一变(biàn )回了(le )小(xiǎo )孩！新一(yī )找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛利(lì )兰(lán )来到了阿笠(lì )博(bó )士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的(de )新一情(qíng )急之下编(biān )造了自己名(míng )叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家(jiā )侦探，新一可以(yǐ )籍着和他(tā )一(yī )起四出(chū )办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南(nán )在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！