工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的阿笠(lì )博士，博士(shì )为(wéi )他度身(shēn )打(dǎ )造(zào )不(bú )少间谍武器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着(zhe )和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一(yī )个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！