工藤新一是全国(guó )著名的(de )高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后(hòu )喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定隐(yǐn )姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解(jiě )药(yào )。一(yī )日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的(de )家寻找(zhǎo )男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯(kē )南寄(jì )居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追(zhuī )查黑夜(yè )人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！