工(gōng )藤新(xīn )一是(shì )全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不(bú )少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报复(fù )，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能(néng )得到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情急之下(xià )编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑(hēi )夜(yè )人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦(zhēn )探团，向罪(zuì )犯宣战！