工藤新一(yī )是全国著名的高中(zhōng )生侦(zhēn )探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸(xìng )被(bèi )团伙成员发现(xiàn )，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博(bó )士，博士为他度(dù )身(shēn )打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复(fù )，新一(yī )决定(dìng )隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希(xī )望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情(qíng )急之下编(biān )造了(le )自己名叫江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生(shēng )，他(tā )们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！