工藤新(xīn )一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪(zuì )团伙(huǒ )时不幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的(de )阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解药(yào )。一日(rì )，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被(bèi )小兰撞见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名(míng )私(sī )家侦探，新(xīn )一可以籍着和他(tā )一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认(rèn )识步美等(děng )小学生，他们一起(qǐ )组织(zhī )了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯(fàn )宣(xuān )战！