工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的(de )药(yào )水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复(fù )，新一决定隐(yǐn )姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造(zào )了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等(děng )小(xiǎo )学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！