工藤新一(yī )是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪(zuì )团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新(xīn )一(yī )变回(huí )了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他(tā )的阿笠博士(shì )，博士为他度(dù )身(shēn )打(dǎ )造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情(qíng )急之下编(biān )造了自己名叫江(jiāng )户川柯南(nán )，随后柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学(xué )生，他们一起(qǐ )组织(zhī )了(le )一(yī )个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！