工(gōng )藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发(fā )现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名(míng )私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一(yī )起四(sì )出办(bàn )案(àn )一起(qǐ )追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个(gè )少(shǎo )年(nián )侦探团，向罪犯(fàn )宣战！