工藤新一是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤(téng )新一变回(huí )了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰(lán )来到了阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友的下落，被小(xiǎo )兰撞(zhuàng )见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他(tā )一(yī )起(qǐ )四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一(yī )起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！