工藤新(xīn )一是(shì )全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团(tuán )伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他(tā )度身打(dǎ )造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己(jǐ )名叫(jiào )江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名(míng )私(sī )家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识(shí )步美等(děng )小学生，他(tā )们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！