工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇(qí )的(de )药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度(dù )身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓(xìng )埋名(míng )，暗中(zhōng )追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利(lì )兰(lán )来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了(le )自己名叫(jiào )江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四(sì )出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学认识步美等(děng )小学生(shēng )，他们一起(qǐ )组织了(le )一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！