工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他的(de )阿笠博士，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的(de )新一情急之下(xià )编造了自己(jǐ )名叫江(jiāng )户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是(shì )一名私家侦探，新(xīn )一可以(yǐ )籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！