工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时(shí )不幸被团(tuán )伙成(chéng )员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间谍(dié )武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男(nán )友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一(yī )情急之下编造了自(zì )己名叫江(jiāng )户(hù )川柯南(nán )，随后柯南(nán )寄居在了小兰(lán )家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新(xīn )一(yī )可(kě )以(yǐ )籍着和他(tā )一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个(gè )少年侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣(xuān )战(zhàn )！