工藤(téng )新一是全国著名(míng )的高中生侦探(tàn )，在一次(cì )追(zhuī )查黑(hēi )衣(yī )人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一(yī )找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍(dié )武(wǔ )器(qì )。为(wéi )了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进行报(bào )复，新一(yī )决定隐姓埋名(míng )，暗中追(zhuī )查(chá )他们，希(xī )望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻(xún )找男(nán )友的下落(luò )，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！